En una carta enviada a medios nacionales, Arias Cabrales expresó que por el momento no desea acogerse a la JEP, sin embargo, no descarta la posibilidad de hacer parte de esta luego de que se expidan la Ley Estatutaria y los Decretos Reglamentarios que señalen el procedimiento y funcionamiento del Tribunal Especial para la Paz y así poder analizar la posibilidad de acogerse a dicho sistema.
El general retirado Jesús Armando Arias Cabrales, quien fue condenado a 35 años por la desaparición de cinco personas en la toma del Palacio de Justicia, manifestó mediante una misiva su decisión de no hacer parte de la Jurisdicción Especial para la Paz (JEP).
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Según la carta firmada por el general (r), enviada al secretario ejecutivo de la JEP, Néstor Raúl Correa y que fue compartida en medios nacionales con fecha del 7 de abril del 2017, Arias Cabrales expresó: "De manera consciente, libre y voluntaria expreso que dejo sin ningún efecto la manifestación de acogerme a la Jurisdicción Especial para la Paz, contenida en el Formulario Consecutivo No. 300673, suscrito el 30 de marzo de 2017".